Los días de tranquilidad de Hikaru Amatsuga llegan a un final repentino cuando rescata a Alma, un brazo mecánico que pide ayuda a gritos. Alma se fusiona con su chaqueta, introduciendo a Hikaru al mundo de las armas mecánicas: armas misteriosas y sensibles que normalmente pasan a formar parte del cuerpo de sus usuarios. Obligado a huir para salvar su vida, Hikaru finalmente es capturado por Aki Murasame, un usuario de armas mecánicas gemelas que trabaja para ARMS, una organización que protege las máquinas contra tratos poco éticos. El Grupo Kagami, una organización nefasta que trata los brazos mecánicos como meras herramientas, busca recuperar a Alma. ARMS considera que Hikaru es un fracaso por su falta de predisposición natural para usar un brazo mecánico, por lo que se asigna a Aki como su guardaespaldas. Pero Aki es derrotada por Jun Kagami, quien cruelmente le arranca sus dos extremidades mecánicas, condenando a la niña a una muerte lenta. No dispuesto a abandonar a Aki a su sombrío destino, Hikaru despierta milagrosamente su poder y neutraliza a Kagami. Ahora como miembro de pleno derecho de ARMS, Hikaru está decidido a desentrañar la verdad sobre las armas mecánicas y proteger a sus nuevos amigos y aliados.